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    Single Cell Sequence Specific Amplification Kit

    貨號 22121 售價(jià)(元) 2150
    規格 200 rxn CAS號
    • 產(chǎn)品簡(jiǎn)介
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    產(chǎn)品描述

            Single Cell Squence Specific Amplification Kit是基于一步RT-PCR的預擴增方法,適用于單細胞或者微量總RNA中轉錄組的擴增,便于進(jìn)行單細胞轉錄組表達差異的分析。本試劑盒實(shí)現了RNA提取純化、逆轉錄和PCR預擴增反應在同一管內完成,不需要額外的操作,簡(jiǎn)單高效,還能減少實(shí)驗誤差和污染風(fēng)險。除了應用于單細胞,本試劑盒亦可適用于2~1,000個(gè)細胞的一步擴增,應用時(shí)僅需按照細胞數目減少一步擴增的循環(huán)數;獲得的擴增產(chǎn)物適合于任何實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析法。染料法和探針?lè )╭PCR分別推薦ToloBio通用型2 × Q3 SYBR qPCR Master Mix (Universal, #22204)和2 × Q3 probe qPCR Master Mix (Universal, #22205)。

     產(chǎn)品優(yōu)勢

    一步法RT-PCR預擴增:細胞裂解、RNA逆轉錄和PCR擴增在同一管內完成,不需要額外的移管操作。
    一次可擴增500個(gè)靶基因:擴增產(chǎn)物適合用任何實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀分析。

     實(shí)驗案例

            分別使用ToloBio #22121與競品Supplier A、Supplier B,對不同濃度的小鼠巨噬細胞進(jìn)行一步法RT-PCR預擴增,產(chǎn)物進(jìn)一步qRCR(ToloBio #22204)擴增,比較在相同引物和相同細胞個(gè)數條件下的擴增情況,包括擴增靈敏度、擴增線(xiàn)性和擴增平臺。結果顯示,ToloBio #22121在不同濃度細胞(1~1000個(gè)細胞/test)條件下擴增性能穩定、優(yōu)異。

     實(shí)驗流程

    1.Primer Pool的制備
            將不同待測基因的擴增引物進(jìn)行混合,制備成Primer Pool,使各引物的終濃度為0.1 μM。以Bcl-2基因為例,其上、下游引物原濃度均為100 μM,則應各取1 μL加入998 μL RNase-free ddH2O至終體積為1 mL。多個(gè)基因引物對的制備依此類(lèi)推,最多可混合500對不同基因的擴增引物。

    2.預擴增反應體系
            在RNase-free離心管中冰上配制如下反應體系:

    組分

           體積

    2 ×Tolo scAmp Reaction Buffer 

           2.5 μL

    Primer Pool (0.1 μM)

           0.5 μL

    RT/Taq Enzyme Mix

           0.2 μL

    Cell sample a

          0.5~1 μL

    RNase-free ddH2O

    Up to 5 μL

    a.細胞可儲存于PBS緩沖液中。
    以上體系(除細胞樣本外)充分混勻后冰上放置備用,可加入1~1000個(gè)細胞樣本。為了使細胞充分破碎,將加入細胞樣本的完整體系置于-80℃冰箱2 min,隨后3,000 rpm (1,000 × g)室溫或4℃離心2 min,然后立即放入PCR儀進(jìn)行如下反應:

    程序

    溫度

    時(shí)間

    循環(huán)數

    反轉錄

    50℃

    60 min

    1 cycle

    預變性

    95℃

    3 min

    1 cycle

    循環(huán)反應 b

     

    95℃

    15 sec

    20 cycles

     

    60℃

    15 min

    Hold

    4℃

    -

    -

    b.建議循環(huán)數隨起始細胞數量作相應調整:1個(gè)細胞20個(gè)循環(huán),10個(gè)細胞17個(gè)循環(huán),100個(gè)細胞14個(gè)循環(huán),1,000個(gè)細胞11個(gè)循環(huán)。 
    反應結束后,每管加入20 μL RNase-free ddH2O (1:5稀釋),用移液器吹打混勻,室溫短離集于管底??闪⒓催M(jìn)行后續qPCR定量反應或-20℃短期保存。

    3.qPCR反應體系
    冰上配制如下反應體系:

    組分

           體積

    2 × Q3 SYBR qPCR Master Mix (Universal,#22204) 

            10 μL

    Primer F (10 μM)    

            0.5 μL

    Primer R (10 μM)

            0.5 μL

    Template DNA c

            1 μL

    ddH2O

      Up to 20 μL

    c.為減少加樣誤差,建議將1:5稀釋的預擴增產(chǎn)物再稀釋10倍后使用。

    以上體系充分混勻后,短暫離心集于管底,隨后立即放入qPCR儀進(jìn)行如下反應:

    Stage

    程序

    溫度

    時(shí)間

             循環(huán)數

    Stage 1

    預變性

    95℃

    5 min

              1 cycle

    Stage 2

     

    循環(huán)反應

     

    95℃

    10 sec

     

            40 cycles

     

    60℃ 

    30 sec

    Stage 3

    熔解曲線(xiàn)

    儀器默認程序

     

               1 cycle

     產(chǎn)品組成

    組分        

    22121 (200 rxns)

     2 × Tolo scAmp Reaction Buffer d

    500 μL

     RT/Taq Enzyme Mix e

    40 μL

    ○ RNase-free ddH2O

    2 × 1 mL

    d.包含 dNTP;
    e.包含RTase、RNase inhibitor和Taq DNA polymerase;

    保存條件

    -20℃保存,≤ 0℃運輸;

     

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