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    染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)(Chromatin Immunoprecipitation,簡(jiǎn)稱(chēng)ChIP)——ChIP-IT? Express 染色質(zhì)免疫共沉淀試劑盒

    染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)(Chromatin Immunoprecipitation,簡(jiǎn)稱(chēng)ChIP——ChIP-IT? Express 染色質(zhì)免疫共沉淀試劑盒

           染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)(Chromatin Immunoprecipitation,簡(jiǎn)稱(chēng)ChIP)是研究體內蛋白質(zhì)與DNA相互作用的一種技術(shù)。其原理是:在生理狀態(tài)下用甲醛把細胞內的DNA與蛋白質(zhì)交聯(lián)在一起,通過(guò)超聲或酶處理將染色質(zhì)切為均一的小片段后,利用抗原抗體的特異性識別反應,使用DNA結合蛋白特異性的抗體將目的蛋白和DNA復合物沉淀下來(lái)。復合物經(jīng)過(guò)洗滌,解交聯(lián),蛋白酶K消化去除DNA結合蛋白,經(jīng)純化得到感興趣的DNA片段。純化的DNA片段可用于后續的分析,比如qPCR,測序,ChIP-chip,ChIP re ChIP等。

           Active motif公司的ChIP-IT? Express試劑盒使用protein G包被的磁珠,代替傳統的瓊脂糖珠,使得ChIP實(shí)驗可以在1天之內完成。試劑盒可以使用超聲法或酶切法進(jìn)行染色質(zhì)的斷裂處理。每種方法都提供快速、可重復的操作步驟,省時(shí)省力,實(shí)驗者更容易獲得成功的ChIP結果。

    1 ChIP-IT? Express試劑盒的操作流程


    ChIP-IT? Express試劑盒的優(yōu)點(diǎn)

    ● 組分完整——提供ChIP實(shí)驗所需的所有試劑;

    ● 可用于檢測蛋白/DNA的相互作用,不僅僅限于組蛋白的修飾;

    ● 與全基因組分析或PCR相關(guān)的方法兼容;

    ● 無(wú)需進(jìn)行試劑和操作步驟的優(yōu)化;

    ● 無(wú)需酚/氯仿抽提步驟——試劑盒包含DNA純化柱,可對DNA進(jìn)行快速純化

    傳統的ChIP實(shí)驗都是使用染色質(zhì)組成相關(guān)的抗體,如乙?;M蛋白抗體。然而對于啟動(dòng)子轉錄活性分析而言,這無(wú)法揭示出是哪種轉錄因子結合到我們感興趣的啟動(dòng)子上。相比之下,使用轉錄因子特異性抗體,能夠直接監測轉錄因子和DNA的相互作用,但是這種技術(shù)與傳統的ChIP相比具有更大的挑戰,需要準備多種復雜的緩沖液,抑制劑混合物和封閉試劑等。而且在缺少抗體、對照和驗證的實(shí)驗流程下,很難對ChIP結果進(jìn)行驗證。為了解決這些問(wèn)題,使得ChIP實(shí)驗同時(shí)適用于轉錄因子和組蛋白,Active motif公司的ChIP-IT? Express試劑盒提供ChIP實(shí)驗所需的所有試劑,包括陽(yáng)性對照和陰性對照,使得研究者更容易成功的操作ChIP。

    圖2: 改良的ChIP(使用ChIP-IT Express試劑盒)

    PCR分析ChIP后的DNA。典型的ChIP實(shí)驗每次需要2000,000個(gè)細胞,使用ChIP-IT Express試劑盒,僅需要100,000或更少的細胞既可獲得陽(yáng)性的ChIP結果。

    1%的甲醛固定Hela細胞10分鐘,使用超聲法破碎染色質(zhì),使用陰性對照IgGRNA pol II抗體,對不同細胞數量來(lái)源(100,000750,000個(gè)細胞)的染色質(zhì)進(jìn)行ChIP,重復2次。使用陽(yáng)性對照引物GAPDHChIP后的DNA進(jìn)行36個(gè)循環(huán)的PCR分析(抗體和引物包含在人ChIP-IT對照試劑盒里,Active motif也可以提供小鼠和大鼠對照試劑盒)。取10ul PCR產(chǎn)物進(jìn)行1%凝膠電泳,EB染色后紫外觀(guān)察。結果顯示與使用陰性對照IgG相比,使用RNA pol II抗體的ChIP大量富集了GAPDH啟動(dòng)子區域的DNA序列。

    相關(guān)產(chǎn)品信息

     供貨商

     產(chǎn)品編號

     產(chǎn)品名稱(chēng) 

     規格

     Active Motif

     53008

     ChIP-IT? Express

     25 rxns

     Active Motif

     53009

     ChIP-IT? Express Enzymatic

     25 rxns

    除此之外,Active motif公司還提供特殊應用的ChIP試劑盒以及多種ChIP相關(guān)的的輔產(chǎn)品。


    供貨商

     產(chǎn)品編號

     產(chǎn)品名稱(chēng)

     規格

     產(chǎn)品說(shuō)明

     Active Motif

     53014

     ChIP-IT? Protein G Magnetic Beads

     25 rxns

     Protein G包被的磁珠

     Active Motif

     53016

     Re-ChIP-IT?

     25 rxns

     雙重ChIP

     Active Motif

     53018

     ChIP-IT? Express HT

     96 rxns

     高通量ChIP,一次可同時(shí)使用96分樣本

     Active Motif

     53019

     Ready-to-ChIP Hep G2 Chromatin

     10 rxns

     即用型的ChIP實(shí)驗用染色質(zhì)

     Active Motif

     53020

     Ready-to-ChIP K-562 Chromatin

     10 rxns

     Active Motif

     53021

     Ready-to-ChIP NIH/3T3 Chromatin

     10 rxns

     Active Motif

     53015

    Ready-to-ChIP HeLa Chromatin

     10 rxns

     Active Motif

     53026

     ChIP-IT? Control qPCR Kit – Human

     5 rxns

     ChIP對照試劑盒,包含陰性對照IgG和陽(yáng)性對照

     RNA pol II抗體和PCR引物

     Active Motif

     53027

     ChIP-IT? Control qPCR Kit – Mouse

     5 rxns

     Active Motif

     53028

     ChIP-IT? Control qPCR Kit – Rat

     5 rxns

     Active Motif

     53010

     ChIP-IT? Control Kit – Human

     5 rxns

     Active Motif

     53011

     ChIP-IT? Control Kit – Mouse

     5 rxns

     Active Motif

     53012

     ChIP-IT? Control Kit – Rat

     5 rxns

     Active Motif

     53032

     ChIP-IT? Express Shearing Kit

     10 rxns

     超聲法染色質(zhì)處理試劑盒

     Active Motif

     53035

     ChIP-IT? Express Enzymatic Shearing Kit

     10 rxns

     酶切法染色質(zhì)處理試劑盒

     Active Motif

     53040

     ChIP-IT? High Sensitivity

     16 rxns

     高靈敏ChIP試劑盒,適用于低豐度轉錄因子、

     低親和力抗體或有限的樣本

     Active Motif

     53041

     ChIP-IT? ChIP-Seq

     10 libraries

     ChIP-Seq劑盒

     Active Motif

     53045

     ChIP-IT? FFPE

     16 rxns

     適用于福爾馬林固定,石蠟包埋組織樣本的ChIP

     Active Motif

     53042

     ChIP-IT? PBMC

     16 rxns

     適用于外周血單核細胞的ChIP

     Active Motif

     53024

     RNA ChIP-IT?

     25 rxns

     用于研究RNA與細胞核染色質(zhì)的相互作用

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