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    CRISPR技術(shù)用于猴痘病毒的快速自測

    痘病毒是一種包膜雙鏈DNA病毒,主要通過(guò)呼吸道飛沫、體液、分泌物、傷口或病毒污染物進(jìn)行傳播。人感染猴痘會(huì )出現發(fā)熱、頭痛、全身酸痛、咳嗽、淋巴腫大等癥狀,還可能并發(fā)細菌感染、敗血癥、肺部感染、呼吸窘迫綜合癥等。阻斷猴痘病毒的傳播主要以預防為主,同時(shí)對病原檢測及時(shí)發(fā)現病毒阻斷病毒的傳播顯得十分重要。一般來(lái)說(shuō),qPCR是猴痘病毒首選的實(shí)驗室檢測方案,但從對抗新冠疫情中得到的經(jīng)驗教訓表明,預防突發(fā)大流行的源頭是向個(gè)人提供快速可靠的即時(shí)診斷工具,抗原檢測在新冠病毒檢測中扮演了這一角色,但也暴露出抗原檢測的準確度仍亟待提升的問(wèn)題。對于猴痘病毒,其抗原的低特異性使其更容易導致假陽(yáng)性結果,因此猴痘病毒的即時(shí)診斷難以通過(guò)抗原檢測的方式實(shí)現。

     

    近日,一項發(fā)表于《Sensors and Actuators B: Chemical》的研究介紹了一款特殊的猴痘病毒檢測裝置,該裝置包含了以RPA和CRISPR-Cas12a技術(shù)作為原理的凍干型檢測試劑,可在35分鐘內完成對猴痘病毒的快速自測。

     

    01RPA-CRISPR/Cas12a檢測猴痘的策略

    該檢測的原理首先利用了RPA法對猴痘病毒核酸指數級擴增的能力,將得到的擴增產(chǎn)物與預先設計好的gRNA和Cas12a酶組成的RNP復合物結合,RNP復合物與猴痘病毒特異性擴增產(chǎn)物的相互作用激活了Cas12a酶的反式切割活性,導致ssDNA報告探針被切割而產(chǎn)生可檢測的熒光。另外,RPA和CRISPR/Cas12a的反應體系具有很好的兼容性,這種集成的RPA-CRISPR/Cas12a反應可以在單一的溫度和單個(gè)試管中進(jìn)行,避免了氣溶膠污染的風(fēng)險,并且提高了檢測的靈敏度和特異性(圖1)。

     

    1.CRPA-CRISPR檢測猴痘病毒的基本原理

     

    02CRISPR 解決恒溫擴增非特異的困局

    研究人員選取了猴痘病毒的B6R和F3L基因作為檢測的靶標,并針對這兩個(gè)基因篩選了多對RPA引物。盡管如此,在對模擬樣本進(jìn)行獨立RPA擴增測試的過(guò)程中仍出現了較多的非特異性擴增,這與RPA方法的擴增原理相關(guān)。為了解決檢測過(guò)程中非特異性擴增的問(wèn)題,研究人員嘗試將CRISPR-Cas12a核酸檢測技術(shù)與RPA方法相結合,并分析相同的樣品。結果證明該方法使檢測的特異性得到了明顯的提升,CRISPR-Cas12a識別了RPA擴增子的特定序列,并將其與非特異性擴增的產(chǎn)物區分開(kāi)來(lái)(圖2)。

     

    2. RPA與CRISPR技術(shù)相結合的必要性

     

    03基于CRISPR的猴痘病毒POCT檢測裝置

    在成功開(kāi)發(fā)了RPA-CRISPR / Cas12a檢測方法后,研究人員將所有試劑進(jìn)行凍干并集成到一個(gè)便攜式的MASTR袋中以檢測猴痘病毒。MASTR 袋中的主要組件包括迷你移液器、即用型管、采樣管、迷你移動(dòng)電源、自動(dòng)讀出裝置和迷你恒溫加熱塊,通過(guò)檢測在RPA-CRISPR/Cas12a部分的同一批次樣品來(lái)驗證MASTR袋的可行性,用于檢測質(zhì)粒和病毒。測試結果表明,陽(yáng)性結果發(fā)出明亮的熒光,陰性結果僅存在較低的背景信號;證明 MASTR 袋具有便攜和操作簡(jiǎn)單的特點(diǎn),且沒(méi)有假陽(yáng)性的結果(圖3)。

     

    3. 基于RPA-CRISPR凍干試劑的即時(shí)診斷裝置

     

    研究人員還使用MASTR袋測試了各種類(lèi)型的模擬臨床標本,結果表明MASTR袋擁有與qPCR實(shí)驗室測試相當的特異性與靈敏度,證明了MASTR袋檢測猴痘病毒的準確性(圖4)。

     

    4. MASTR袋的性能驗證 

    盡管如此,該研究在也存在一定的局限性,主要體現在未能獲得并檢測真實(shí)的猴痘臨床標本,但這與當前猴痘患者的總體數量稀少相關(guān)。不可否認的是,這款RPA-CRISPR凍干型裝置在猴痘病毒的即時(shí)檢測方面具有較大的潛力,有望通過(guò)早期疾病的檢測來(lái)幫助防控猴痘疫情。 

    相關(guān)產(chǎn)品

    貨號

    產(chǎn)品名稱(chēng)

    規格

    32104-01

    AsCas12a(Cpf1)

    100 pmol

    32104-03

    1000 pmol

    32116-01

    AacCas12b(C2c1)

    100 pmol

    32116-03

    1000 pmol

    32106-01

    FnCas12a(Cpf1)

    100 pmol

    32106-03

    1000 pmol

    32110-01

    Lb5Cas12a(Cpf1)

    100 pmol

    32110-03

    1000 pmol

    32101-01

    SpCas9

    100 pmol

    32101-03

    1000 pmol

    32102-01

    Sp-dCas9

    100 pmol

    32102-03

    1000 pmol

     

    貨號

    產(chǎn)品

    規格

    JY0209

    雙靶標HybriDetect側向層析試紙條(彩虹型)

    50T

    JY0307

    Tiosbio? CRISPR單酶切及擴增產(chǎn)物檢測試紙條

    50T

    JY0301

    CRISPR Cas12/13 HybriDetect試紙條

    50T

    JY0308

    Tiosbio? CRISPR雙酶切檢測試紙條(變色龍)

    50T

    WLB8201KIT

    DNA恒溫快速擴增試劑盒(基礎型)

    48T

    WLE8202KIT

    DNA恒溫快速擴增試劑盒(熒光型)

    48T

    WLN8203KIT

    DNA恒溫快速擴增試劑盒(膠體金試紙條型)

    48T

    WLRB8204KIT

    RNA恒溫快速擴增試劑盒(基礎型)

    48T

    WLRE8205KIT

    RNA恒溫快速擴增試劑盒(熒光型)

    48T

    WLRN8206KIT

    RNA恒溫快速擴增試劑盒(膠體金試紙條型)

    48T

    WLB5001

    DNA恒溫快速擴增試劑盒(液體基礎型)

    100T

    WLN5002

    DNA恒溫快速擴增試劑盒(液體膠體金型)

    100T

    WLR5003

    DNA恒溫快速擴增試劑盒(液體熒光型)

    100T

    WLRB5001

    RNA恒溫快速擴增試劑盒(液體基礎型)

    100T

    WLRN5002

    RNA恒溫快速擴增試劑盒(液體膠體金型)

    100T

    WLRE5003

    RNA恒溫快速擴增試劑盒(液體熒光型)

    100T


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