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    HOLMES ssRNA reporter (FAM)

    貨號 31111 售價(jià)(元) 1000
    規格 1 OD CAS號
    • 產(chǎn)品簡(jiǎn)介
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    產(chǎn)品簡(jiǎn)介

            HOLMES ssRNA reporter (FAM)是單鏈RNA寡核苷酸探針,5′端標記FAM熒光報告基團(Reporter),3′端標記熒光淬滅基團(Quencher)。當HOLMES ssRNA reporter探針完整時(shí),報告基團發(fā)射的熒光信號會(huì )被淬滅基團淬滅。而當HOLMES ssRNA reporter探針被切斷后,5'端的FAM熒光報告基團和淬滅基團分離,從而發(fā)出可被檢測的熒光信號。常見(jiàn)的Cas13酶在與guide RNA、target RNA組成三元復合物后,都會(huì )被激發(fā)出針對ssRNA的反式剪切活性(或稱(chēng)為旁路切割活性),將HOLMES ssRNA reporter探針切碎,并發(fā)出熒光信號。
    HOLMES ssRNA reporter (FAM)探針經(jīng)過(guò)特別的序列優(yōu)化,對Cas13反式切割活性高度敏感,可作為Cas13家族蛋白反式切割反應的報告探針,廣泛用于CRISPR診斷反應體系以便對靶標核酸進(jìn)行快速檢測。

     實(shí)驗流程

    1.反式剪切實(shí)驗體系

    組分

    體積

         終濃度

    10 × HOLMES Buffer 1

    2 μL

             1 ×

    10 μM Cas13 Nuclease

    0.05~0.5 μL

            25~250 nM

    10 μM guide RNA

    0.05~0.5 μL

             25~250 nM

    10 μM Target DNA

    0.05~0.5 μL

            25~250 nM

    10 μM HOLMES ssDNA reporter 

    0.05~0.5 μL

            25~250 nM

    Nuclease-free water

    Up to 20 μL

     

    ◆ 反式剪切體系中各組分的用量可以根據不同的實(shí)驗目的進(jìn)行調整,用量較少時(shí)可先將各組分稀釋后加入體系;
    ◆ 建議使用低吸附的離心管、吸頭等耗材;
    ◆ 反式剪切體系中探針的用量和預期反應到達平臺期的時(shí)間可參考各批號Cas酶transU的具體數值,詳見(jiàn)本公司提供的COA檢測報告。
    實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀檢測熒光信號,每30 sec采集一次熒光信號,反應溫度根據不同的Cas13酶最適溫度進(jìn)行設定。

     產(chǎn)品組分

    組分

               31111

     HOLMES ssDNA reporter (FAM) a

                 1 OD

    a.HOLMES ssRNA reporter (FAM)總量為1 OD (約為8.45 nmol),為干粉狀態(tài)。使用前請先短暫離心,然后加入84.5 μL DNase/RNase-Free Water溶解,得到濃度為100 μM的貯存液,在無(wú)反復凍融的條件下可于-80℃避光保存6~12個(gè)月。使用前再將貯存液用DNase/RNase-Free Water稀釋成10 μM的工作液,按下表推薦的濃度加入CRISPR剪切反應體系中。剩余工作液可于-20℃避光保存,3~6個(gè)月內使用。

     保存條件

            -80℃避光儲存;≦4℃運輸。

     

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